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《医学寄生虫学》

欧猥迭宫绦虫膜联蛋白E1基因的生物信息学分析

发表时间:2012-12-13  浏览次数:1204次

引 用:

邬强,李东冬,马盼盼,吕刚.欧猥迭宫绦虫膜联蛋白E1基因的生物信息学分析[J].海南医学院学报,2010,16(9).

关 键 词:

欧猥迭宫绦虫,膜联蛋白,结构,功能,生物信息学

作者:

邬强,李东冬,马盼盼,吕刚

作者单位:

出版年份:

2010

期刊页数:

收录者:

知网,万方

摘要:

目的:从欧猥迭宫绦虫成虫cDNA文库中识别出膜联蛋白E1(Annexin E1)基因,并对其进行生物信息学分析和功能预测。方法:从欧猥迭宫绦虫cDNA文库中获取Annexin E1基因的核酸序列,应用NCBI、ExPASy等多种生物信息学在线分析工具结合Vector NTI Advance 10、Geneious Pro等软件包,对所获基因及其编码蛋白的基本理化特征、亚细胞定位、保守功能域、抗原表位、二级结构及拓扑结构等进行预测,建立蛋白质三级空间结构模型及构建其分子进化树。结果:Annexin E1编码354个氨基酸残基,理论分子量为40168.0Da,具有4个完整的保守功能域。位于细胞内,无信号肽及跨膜结构,存在6个潜在抗原表位。二级结构主要以α 螺旋为主,结构和功能有关的位点高度保守,具有多个磷酸化位点。在进化的过程中与绦虫类亲缘较近,而与脊椎类亲缘较远。结论:Annexin E1编码蛋白及潜在的抗原表位与宿主同源性低,可能作为研发新型免疫诊断方法的理想分子靶标。

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