肿瘤坏死因子β G252A、C804A基因多态性与脑梗死的关系
发表时间:2010-03-31 浏览次数:504次
作者:涂传清, 余卓丽, 王笑碧, 徐 波 作者单位:(1.深圳市宝安人民医院血液科 深圳 518101 2.佛山市血液中心 佛山 528000) 【摘要】 目的 探讨肿瘤坏死因子β(TNFβ)G252A、C804A 多态性与脑梗死(CI)的相关性。方法 采用PCR RFLP及PCRSSP技术研究88例CI患者(CI组)、81例健康者(对照组)TNFβ G252A、C804A 多态性频率。结果 CI组TNFβ C804A基因型(CC型18.2%、CA型47.7%、AA型34.1%)与对照组(38.3%、42.0%、19.7%)相比差异有统计学意义(P<0.05);其中CI组AA频率为34.1%,对照组为19.7%,两者有显著性统计学意义(P<0.05);CA+AA基因型CI的风险度为2.101(95%CI为1.048~2.954);CI组CC基因型为18.2%,对照组为38.3%,两组有显著性统计学意义(P<0.05);CI组TNFβ G252A基因型频率与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 TNFβ 804A等位基因可能是CI的重要易感基因, 而804C等位基因可能是其保护性因素。TNFβ G252A基因多态性可能与CI无相关性。
【关键词】 脑梗死; 肿瘤坏死因子β; 聚合酶链反应; 基因多态性
Association Between Polymorphisms of Tumor Necrosis Factorbeta and Cerebral Infarction
TU Chuanqing, YU Zhuoli, WANG Xiaobi, XU Bo.
(Department of Heamatology, Baoan People’s Hospital, Shenzhen 518101,China)
Abstract: Objective To investigate the association between polymorphism of tumor necrosis factorbeta and cerebral infarction(CI).Methods Polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR RFLP) and sequence specific primer PCR (PCRSSP) were used for the detection of TNFbeta genotype in 86 patients with CI and 81 healthy controls.Results The frequencies of CC, CA and AA genotypes of C804A in CI group and control were 18.2% and 47.7%, 34.1% and 38.3%, 42.0% and 19.7%, respectively; there were statistically significant differences in the distributions of the genotypes (P<0.05) and the allele frequencies (P<0.05) between the two groups; the risk of suffering from CI in those of AA and CA genotypes was 2.101 times that in those of CC genotype (OR=2.011, 95%CI:1.048~2.954). There was no significant difference in the distribution of the genotype of G252A between the two groups (P>0.05).Conclusion The single nucleotide polymorphism at position 804 in the exon 3 of TNFbeta gene is associated with CI and the allele A may be a risk factor for CI.The polymorphism of G252A may not play an important role in the pathogenesis of CI.
Key words: Cerebral infarction; Tumor necross factor β; Polymerase chain reaction; Gene polymorphism
脑梗死(cerebral infarction,CI)是一种常见的动脉血栓性疾病, 其血栓形成的机制复杂,可能与多种基因的多态性相关[1]。目前,炎症反应在血栓中的作用已引起广泛注意。血栓形成常伴有炎症反应,炎症部位易形成血栓。肿瘤坏死因子β(tumor necrosis factorβ,TNFβ)是一种促炎因子,在炎症反应和免疫调节中起着重要作用。近年来,国外一些研究发现,TNFβ基因G252A和C804A多态性可影响TNFβ的表达水平, 并可能与动脉血栓性疾病有关[2,3]。国内也有作者对TNFα及TNFβ基因某些位点的多态性与冠心病及CI易感性进行了初步研究,但结果与国外报道不尽一致[4,5]。为了解中国人TNFβ基因G252A和C804A多态性与CI的关系,作者对88例CI患者及81例正常人TNFβ基因多态性进行分析,以探讨中国人TNFβ基因多态性在CI患者发病中的作用及临床意义。
1 对象和方法
1.1 研究对象 CI组88例,为深圳市宝安人民医院2005年11月~2006年12月的住院患者,均符合1996年全国脑血管病学术会议修订的诊断标准,并经CT或MRI证实。排除标准:(1)短暂性脑缺血发作者,(2)合并颅内出血者,(3)风心病或房颤并脑栓塞者;其中男47例,女41例,年龄51~79岁,平均年龄60.4±8.9岁。对照组81例,男 47 例,女34例,年龄39~76岁,平均年龄58.9±5.1岁,系本院体检中心健康体检者,按照WHO MONICA方案的危险因素标准,除外心、脑血管疾病。
1.2 方法
1.2.1 试剂 DNA分离纯化试剂盒(puregene DNA isolarion kits)为Gentra公司产品;Taq DNA聚合酶、dNTPmix、NcoI 限制性内切酶为MBI Fermentas公司产品;DNA Ladder为BBI公司产品。PCR引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。PCR 清洁试剂盒为Vgene公司产品。
1.2.2 DNA抽提 清晨空腹抽取外周静脉血2 ml, 以枸橼酸抗凝,用DNA分离试剂盒从全血中分离白细胞的基因组DNA,操作按试剂盒说明进行。
1.2.3 PCR引物设计及合成 参照有关文献[6,7]设计引物, P1: 5′AGAGCTGGTG GGGACATGTCTG3′; P2: 5′CCGTGCTTCGTGCTTTGGACTA3′; P3: 5′GAGGTGAGCAGCAGGTTTGAGGG3′; P4: 5′GAGGTGAGCAGC AGGTTTGAGGT3′。P1、P2扩增第1内含子至第3外显子的一段基因, 长度为740 bp;P3、P4是针对TNFβ 804等位基因的两条序列特异性引物,分别与P2配对,构成两套内引物,扩增特异性694bp的条带。
(1)G252A基因型采用PCRRFLP方法鉴定, 扩增体系为50 μl,含引物P1、P2各40 pmol, dNTP 0.05mmol/L,Taq DNA聚合酶2 u,模板DNA 8 μl,10×PCR缓冲液(含25 Mm MgCl2)。扩增条件:95℃预变性6 min,按以下条件循环30次:95℃变性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸30 s。末次循环后,72℃再延伸7 min。取10 μl纯化后的PCR扩增产物,加5 u NcoⅠ限制性内切酶于37℃孵育16 h,酶切产物经含溴化乙锭的1.5%琼脂糖凝胶电泳以确定基因型。
(2)C804A基因型采用PCRSSP技术鉴定,扩增体系为50 μl,含序列特异性引物P2、P3(或P4)各20 pmol, dNTP 0.05 mmol,Taq DNA聚合酶 2 u,上述P1、P2引物扩增的产物(740 bp)2μl作模板,10×PCR缓冲液(含25Mm MgCl2)。扩增条件:95℃预变性6 min,加入Taq酶,按以下条件循环7次:95℃变性45 s,65℃退火5 s,72℃延伸30 s。末次循环后,72℃再延伸7 min。扩增产物经纯化后用含溴化乙锭的1.5%琼脂糖凝胶电泳以确定基因型。
1.3 统计学分析 应用SAS8.0软件包进行统计分析。计量资料组间比较用t检验。计数资料的组间比较采用χ2检验,以双侧P<0.05为有统计学显著性差异。不同基因型与疾病的关系采用Logistic回归分析,关联程度用比值比(Odds Ratio,OR)及其95%可信区间(CI)表示,以OR的95% CI不包含1为统计学上差别有显著性意义。
2 结 果
2.1 基因型的确定
2.1.1 TNFβ G252A基因型的确定 P1、P2引物扩增的产物为740 bp DNA片段,在这个片段中存在1个NcoⅠ酶切位点,可将此片段切成555 bp、185 bp两个片段。当TNFβ 3号外显子上的252号密码子发生G→A突变时,消除了NcoⅠ酶切位点。所以,当受检个体为GG型时,PCR产物经NcoⅠ酶切后琼脂糖凝胶电泳可见555 bp和185 bp两条带;若为GA杂合子,则可见740 bp、555 bp和185 bp 三条带;若为AA型时,只可见740 bp一条带(图1)。
图1 TNFβ G252A基因多态性1.5%琼脂糖凝胶电泳结果
M:DNA分子量参照(100bpDNA)1:740bp的目的基因;2:GA基因型;3:AA基因型;4:GG基因型
2.1.2 TNFβ C804A基因型的确定 P3、P4引物的唯一区别在于其最后一个碱基不同,前者为G,后者为T,两者分别与P2配对,构成两套内引物,可扩增出特异性694 bp的条带。只能被P3扩增出694 bp条带的受检个体为CC型;只能被P4扩增出694 bp条带的受检个体为AA型,既能被P3又能P4扩增出694 bp条带的受检个体为CA型(图2)。
图2 TNFβC804A基因多态性1.5%琼脂糖凝胶电泳结果
M:DNA分子量参照(100 bpDNA)1:740 bp基因片段;2、3:CC基因型;4、5:CA基因型;6、7:AA基因型
2.2 基因型频率分析
2.2.1 TNFβ C804A基因型频率分析 CI组TNFβ 804位点CC型、CA型、AA型频率分别为18.2%、47.7%、34.1%,而对照组则分别为38.3%、42.0%、19.7%,两组比较差异有统计学意义(χ2=9.617,P=0.009);CI组TNFβ 804位点C和A等位基因频率分别为42.0%、58.0%,对照组分别为59.3%、40.7%,两组比较差异有统计学意义(χ2=9.998,P=0.002),见表1。基因频率的相对风险分析发现,AA+CA基因型发生CI的风险是CC型的2.101倍,95%CI为1.048~2.954。
2.2.2 TNFβ G252A基因型频率分析 CI组TNFβ G252A基因型分布(GG型34.1%、GA型40.9%、AA型25.0%) 与对照组(24.7%、46.9%、28.4%) 比较,差异无统计学意义(χ2=1.789, P=0.409)。见表2。表1 CI组与对照组TNFβ C804A基因型频率及等位基因频率比较 表2 CI组与对照组TNF-βG252A基因型频率及等位基因频率比较
3 讨 论
TNFβ是TNF家族中重要的成员之一。TNFβ除具有抗肿瘤、抗病毒、免疫调节功能外,近年来还发现TNFβ与血栓形成的发生关系密切。TNFβ可激活中性粒细胞及血管内皮细胞,使其表达细胞间黏附分子1及内皮细胞黏附分子1,从而导致白细胞和内皮细胞间相互作用,释放大量活性氧与弹性蛋白酶,损伤血管内皮细胞,刺激组织因子表达,抑制凝血酶调节蛋白合成,破坏凝血抗凝血平衡,促进血栓形成。TNF亦可抑制血管内皮细胞表达组织纤溶酶原激活剂,并促进纤溶酶原激活剂抑制物1的表达,导致纤溶活性降低,有利于血栓形成[8]。
研究表明,CI患者血浆中TNFβ水平比正常组高,其原因可能由于CI组的TNFβ 252位点AA基因型频率分布与正常人比较有统计学差异[3,4]。
Szolnoki等[9]对TNFβ G252A和TNFβ C804A基因多态性与缺血性卒中关系进行了研究,发现缺血性卒中组TNFβ 252G和TNFβ 804C纯合子为13.9%, 而对照组为7.20%, 两组比较差异有显著性(P<0.025), 提示TNFβ 252G 和804C与缺血性卒中的易感性相关。在冠心病的研究中发现,TNFβ 804A等位基因可能是冠心病发生的易感基因,而TNFβ 252G与冠心病病变严重程度有一定关系[5]。
本文研究结果显示,在中国南方CI患者中TNFβ 804位点CC型、CA型、AA型频率分别为18.2%、47.7%、34.1%,而对照组则分别为38.3%、42.0%、19.7%,两组比较差异有统计学意义(χ2=9.617,P=0.009);CI组TNFβ 804位点C和A等位基因频率分别为42.0%、58.0%,对照组分别为59.3%、40.7%,两组比较差异有统计学意义(χ2=9.998,P=0.002)。基因频率的相对风险分析发现,AA+CA基因型发生CI的风险是CC型的2.101倍,95%CI为1.048~2.954,提示TNFβ 804A等位基因可能是CI的易感因素,这与国内在冠心病方面的研究结论基本一致。CI组TNFβ G252A基因型分布(GG型34.1%、GA型40.9%、AA型25.0%) 与对照组(24.7%、46.9%、28.4%) 比较,差异无统计学意义(χ2=1.789, P=0.409) ,提示肿瘤坏死因子β G252A基因多态性可能与CI无相关性。
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