APC基因异常甲基化在上皮性卵巢癌中的检测及临床意义
发表时间:2009-08-17 浏览次数:450次
作者:孙健 卢健 邹冬芳 吴国平 作者单位:200052 上海 解放军第85医院妇产科(孙健,邹冬芳,吴国平)
【摘要】目的 观察结肠腺瘤性息肉病 (APC) 基因异常甲基化在上皮性卵巢癌中的作用及临床意义。方法 59例上皮性卵巢癌组织原发灶,32例相应的盆、腹腔转移灶,12例癌旁卵巢组织及30例正常卵巢组织,采用甲基化特异性聚合酶链式反应(MSP)法检测APC基因启动子区甲基化状态。结果 上皮性卵巢癌组织原发灶及相应的盆、腹腔转移灶中存在APC基因启动子区异常甲基化,发生率分别为32.2%、40.6%,显著高于正常卵巢组织(P<0.01)。12例癌旁卵巢组织中1例检测到APC基因启动子区甲基化,30例正常卵巢组织未检测到。APC基因启动子区甲基化的发生率在临床Ⅰ、Ⅱ期低于Ⅲ、Ⅳ期(P<0.05),在高分化癌中低于低分化癌(P<0.05)。结论 APC基因启动子区异常甲基化与上皮性卵巢癌发生密切相关,并可能与上皮性卵巢癌临床分期及分化程度有关。
【关键词】卵巢癌; APC基因; DNA甲基化
Hypermethylation of APC Gene Promoter in Epithelial Ovarian Carcinoma SUN Jian,LU Jian,ZOU Dongfang,et al.Department of gynecology and obstetrics,the 85th Hospital of PLA,Shanghai 200052,China
【Abstract】 Objective To observe the role of promoter hypermethylation of adenomatous polyposis coli (APC) gene in the course of epithelial ovarian carcinoma. Methods Hypermethylation of APC promoter was detected by methylation specific PCP (MSP) in 59 epithelial ovarian cancer primary tissues, 32 metastatic tissues of pelvic and abdomen cavity, 12 adjacent noncancerous ovarian tissues and 30 normal ovarian tissues. Results Hypermethylation of APC promoter was detected in ovarian cancer tissues and metastatic sites,the frequency being 32.2% and 40.6% respectively, which was significantly higher than that in normal ovarian tissues(P<0.01).Hypermethylation of APC promoter was detected in 1 out of 12 adjacent noncancerous ovarian tissues,and no hypermethylation was detected in normal ovarian tissues.The frequency of hypermethylation of APC promoter was significantly lower in cancers of stage I and Ⅱ than that in stage Ⅲ and IV (P<0.05),and so was that in well differentiated cancers than that in poorly differentiated ones. Conclusion Promoter hypermethylation of APC plays an important role in the course of epithelial ovarian carcinoma, and it is related to clinical stage and histopathological grade in epithelial ovarian carcinoma.
【Key words】 Ovarian carcinoma;APC gene;DNA hypermethylation
结肠腺瘤性息肉病 (adenomatous polyposis coli,APC) 基因是一种抑癌基因,该基因启动子区CpG岛甲基化可使APC蛋白缺失。近来发现在结直肠癌、乳腺癌、肺癌、子宫内膜癌、食管癌、膀胱癌、胃癌、T淋巴细胞瘤等肿瘤中均有APC基因超甲基化[1],然而对上皮性卵巢癌中APC基因甲基化相关的系统分析还少见报道。我们以上皮性卵巢癌为对象,用甲基化特异性聚合酶链反应(methylationspecific PCR,MSP)法对APC基因甲基化进行检测,观察APC基因甲基化后对APC mRNA表达的影响,并进一步探讨其临床意义。
1 资料与方法
1.1 临床资料 59例原发上皮性卵巢癌组织、32例相应的盆、腹腔转移灶、12例癌旁卵巢组织及30例正常卵巢组织取自2001~2006年本院妇科及上海市第一妇幼保健院手术治疗的患者,术前均未经放疗和化疗,术后经病理学诊断及组织学分级皆明确。患者手术后立即取材,置于液氮中速冻后转入-70℃冰箱冻存。59例上皮性卵巢癌患者平均48.2岁(39~68岁),其中浆液性囊腺癌30例,粘液性囊腺癌l8例,子宫内膜样癌9例,透明细胞癌2例。根据细胞分化程度分为:高分化17例,中分化19例,低分化23例。32例相应的盆、腹腔转移灶取自大网膜20例,子宫直肠窝转移结节9例,肠管浆膜面转移结节2例,侧腹壁浆膜面转移结节l例。非癌卵巢组织12例取自上述Ⅰ、Ⅱ期患者癌旁“正常”卵巢组织。30例正常卵巢组织取自因子宫疾病或卵巢良性病变切除的卵巢组织,患者平均49.5岁(39~59岁)。
1.2 甲基化特异性PCR
1.2.1 组织DNA提取 常规酚氯仿异戊醇法提取组织DNA,紫外分光光度法检测DNA浓度和纯度。
1.2.2 DNA修饰及纯化 取2 μg DNA,在50 μl反应体系中加入3 mol/L NaOH 5 μl,混匀后75℃ 15 min。加入新鲜配置的20 mmol/L氢醌12.6 μl和4.8 mol/L亚硫酸氢钠320 μl(Sigma公司),混匀后加入10 μl矿物油,55℃水浴过夜。每个DNA样本中加入1 ml DNA纯化树脂(Promega公司),混匀后通过纯化柱,再加入2 ml 80%异丙醇溶解树脂。3 mol/L NaOH脱硫,5 mol/L醋酸钠、100%冰乙醇沉淀,75%乙醇吹洗DNA。离心后弃上清液,溶于30 μl TE溶液备用。
1.2.3 甲基化特异PCR反应 反应体系共25 μl,包括样品DNA 2 μl,10×PCR buffer 2.5 μl,引物各0.5 μl,dNTP 2 μl,Taq酶0.2 μl,双蒸水17.3 μl。反应条件:95℃预变性5 min;94℃ 30 s,57℃ 45 s,72℃ 30 s,35个循环;72℃延伸10 min。甲基化反应退火温度57℃,非甲基化反应退火温度54℃。以甲基转移酶SssⅠ处理和未处理的正常人外周血细胞DNA作为阳性对照和阴性对照,以双蒸水作为空白对照。引物序列:甲基化引物:上游引物F5’GGTATATTTTCGAGGGGTACG3’,R5’TTCCCGACCCGCACTCCGC3’,预期产物为90 bp;非甲基化引物:F5’TGTGAGGGTATATTTTTGAGGGGTAT3’,R5’CTTCTCTCTCCACTTCCCAACCCA3’,预期产物为109 bp[2],由上海生工合成。
1.2.4 电泳 取PCR产物5 μl,应用2%琼脂糖凝胶电泳,实验重复3次。
1.3 荧光定量PCR(FQPCR)检测组织标本APC mRNA表达的影响 为检测组织标本APC mRNA表达的影响,我们用SYBR Green Ⅰ 荧光染料进行了FQPCR:①按Trizol试剂说明提取组织标本总RNA;②引物序列:APCmRNA:F5’GAGACAGAATGGAGGTGCTGC3’。R5’GTAAGATGATTGGAATTATCTTCT3’,预期产物为170 bp[3]; GAPDHmRNA:F5’AACGGATTTGGTCGTATTGGG3’,R5’TTGATTTTGGAGGGATCTCGC3’,预期产物为233 bp,由上海生工合成:③逆转录第一链cDNA合成:取总RNA 10 μl,Oligo(dT) 5 pmols,65℃ 5 min之后插人冰中,加入5×Buffer 4 μl,10 mmol/L dNTPs 2 μl,MMLV逆转录酶100 U,RNase抑制剂20 U,加DEPC水至20 μl,42℃ 1 h;④FQ-PCR反应体系为25 μl,其中包含0.7 μl SYBR Green Ⅰ 染料,Mg2+浓度为3.5 μmol/L,扩增条件为95℃ 5 min,95℃ 30 s,56℃ 30 s,72℃ 30 s,共50个循环后,72℃延伸7 min,每样本4个复孔,在CFD-3220 DNA Engine Option自动荧光PCR仪上进行反应。
1.4 统计学方法 采用χ2检验及Fisher检验法对甲基化频率进行比较。
2 结果
2.1 上皮性卵巢癌组织中APC基因启动子区甲基化状态 59例上皮性卵巢癌组织原发灶中19例(32.2%)检测到APC基因启动子区甲基化,32例盆、腹腔转移灶中13例(40.6%)检测到APC基因启动子区甲基化。12例癌旁卵巢组织1例(8.3%)检测到APC基因启动子区甲基化。30例正常卵巢组织未检测到APC基因启动子区甲基化。上皮性卵巢癌组织原发灶及转移灶与正常卵巢组织中APC基因启动子区甲基化率相比差异有统计学意义(P<0.01)。盆、腹腔转移灶中APC基因启动子区异常甲基化率高于卵巢癌组织原发灶,但差异无统计学意义(P>0.05),见图1(封2)。
2.2 APC基因启动子区甲基化与上皮性卵巢癌临床病理特征的关系 上皮性卵巢癌组织中APC基因启动子区甲基化的发生率在高分化癌中显著低于低分化癌(P<0.05),在浆液性癌、粘液性癌和内膜样癌之间差异无显著性意义;临床Ⅰ、Ⅱ期显著低于Ⅲ、Ⅳ期(P<0.05),见表1。 表1 上皮性卵巢癌临床病理特征与APC基因启动子区甲基化的关系注:与高分化癌比较,P<0.05;与Ⅰ、Ⅱ期相比较,△P<0.05。
3 讨论
近年来,随着对卵巢癌发病机制的深入研究,基因甲基化在卵巢癌中的作用己受到广泛的关注,DNA甲基化是肿瘤抑制基因突变失活及缺失失活之外基因失活的第三种机制。抑癌基因甲基化是一种可遗传的、酶诱导的、对抑癌基因结构的特殊碱基序列有特异性的稳定作用,即在甲基转移酶作用下将一个甲基集团加到抑癌基因DNA分子核苷酸碱基上,以胞嘧啶的5’羧基端被甲基化最为常见。
DNA甲基化异常在包括卵巢癌、胃癌等多种肿瘤的发生中起重要作用[3]。目前诸多基因启动子位点超甲基化的研究已经应用于提高卵巢癌的诊断率,并且可以进一步揭示卵巢癌发生和浸润转移的机制。Wiley等[4]采用基因检测方法研究234例恶性或低度潜在恶性卵巢肿瘤患者,认为多种抑癌基因(BRCA1,hMLH1,p16,IGFBP3,ERa)超甲基化在卵巢癌的发生发展中起重要作用。Makarla等[5]也通过研究8种肿瘤抑制基因和癌症相关基因(p16,RAR β,Ecadherin,Hcadherin,APC,GSTP1,MGMT,RASSFIA)启动子区域超甲基化来了解在卵巢癌的发生机制,说明在浸润性卵巢上皮癌启动子区域的超甲基化是一种普遍现象。而且特定基因异常甲基化的累积作用可激发良性或低度恶性肿瘤向恶性转化。
APC基因是一种抑癌基因,位于5q2122,编码2 844个氨基酸蛋白质,其分子量为312 kd。在Wnt信号途径中,当APC蛋白和β连环蛋白(βcatenin,βcat)结合时,可促进βcat磷酸化,继而βcat可在蛋白酶体中降解。APC基因在部分肿瘤组织中表达常减少或缺失,与基因5’端启动子区域的CpG岛异常甲基化有关。APC基因启动子区CpG岛甲基化可使APC蛋白缺失。一旦APC蛋白缺失,就不能和βcat结合,累积的βcat转位到细胞核和Tcf4结合成复合体,启动增殖相关基因(如cmyc)转录,最终导致细胞生长失控[6]。
本研究检测上皮性卵巢癌组织原发灶中APC基因启动子区甲基化发生率为32.2%,高于正常卵巢组织(P<0.01),表明APC基因启动子区甲基化与上皮性卵巢癌发生密切相关。同时,卵巢癌盆、腹腔转移灶中APC基因启动子区甲基化发生率40.6%,高于上皮性卵巢癌原发灶和正常卵巢组织,表明APC基因启动子区甲基化可能与上皮性卵巢癌临床浸润转移相关。另外,APC基因启动子区甲基化在临床Ⅰ、Ⅱ期低于Ⅲ、Ⅳ期,在高分化癌中APC基因启动子区甲基化所占比率明显低于低分化癌,表明APC基因启动子区甲基化与上皮性卵巢癌临床分期和细胞分化程度相关,多发生在临床Ⅲ、Ⅳ期和低分化者,可能与卵巢癌临床进展相关。由此可以推测APC基因可能是与上皮性卵巢癌发生发展相关的重要的抑癌基因,由于启动子区异常甲基化而导致表达失活。本研究发现在正常卵巢组织中APC基因呈非甲基化状态,表明DNA甲基化是肿瘤发生发展的特有事件,而癌旁非癌卵巢组织1例检测到APC基因启动子区甲基化,这可能反映了这些组织虽然病理形态是正常的,但是卵巢上皮细胞在分子水平可能己经发生改变,同时也说明甲基化可能作为癌变早期事件。
基因甲基化的研究将广泛应用于卵巢肿瘤的分类、早期诊断、治疗以及预测肿瘤转移复发等[7-9]。全面了解卵巢癌基因组中的甲基化状态,分析基因甲基化产生和维持的机制有助于促进卵巢癌的研究,并为卵巢癌的治疗提出新策略。
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