MUC6基因的一个单核苷酸多态性与胃癌没有关联
发表时间:2011-11-03 浏览次数:427次
作者:贾彦彬,张建祖,闫艳,高静 作者单位:1.包头医学院病原生物教研室,内蒙古包头 014010;2.包头医学院第一附属医院
【摘要】目的:检测粘液素MUC6基因单核苷酸多态性(SNP)rs7943115与胃癌的关系。方法:应用TaqMan方法对272名胃癌患者和374名健康者进行基因分型,并用非条件性Logistic回归分析所检测的SNP与胃癌的关系。结果:MUC6基因SNP与胃癌的发病没有关联。结论:SNP7943115在胃癌的发病过程中不起主要作用。
【关键词】 胃癌,粘液素,MUC6基因;单核苷酸多态性
Abstract Objective:To evaluate the association of rs7943115 in the MUC6 gene of mucin with the risk of gastric cancer. Methods: SNP rs7943115 were genotyped among 272 cases with gastric cancer and 374 normal controls by TaqMan method. And data were analyzed using unconditional logistic regression to evaluate the association of the SNP with gastric cancer. Results: No association was found between the SNP examined in the present study and the incidence of gastric cancer. Conclusion: SNP rs7943115 does not play a major role in the development of gastric cancer.
Key words Gastric cancer; Mucin; MUC6; Single nucleotide polymorphism (SNP)
幽门螺旋杆菌已被世界卫生组织确定为胃的致癌原。然而,在全世界大约有半数人感染幽门螺旋杆菌,只有极少数人最终发展为胃癌,说明个体的遗传因素在疾病的发生过程中起到了重要的作用[1]。现已证实,胃癌是复杂的多基因疾病。在人体中,幽门螺旋杆菌主要寄居在胃粘膜层,而粘液素是粘膜粘液层的主要成分[2]。正常胃粘膜特异性地表达粘液素MUC6[3]。有研究显示在胃癌发生过程中MUC6基因表达异常[4],提示MUC6基因可能与胃癌有关。因此在本研究中,我们检测了MUC6基因的单核苷酸多态性(SNP)rs7943115 C/T与胃癌的关系。
1 材料与方法
1.1 样本
我们收集了272例胃癌患者和374例健康者的新鲜血液,所有癌症患者均由病理学确诊,其中男性184名,女性88名,年龄36~80岁,平均年龄64岁;健康对照者中男性243名,女性131名,年龄35~80岁,平均年龄63岁。病例组和健康对照组在性别和年龄分布方面差异无统计学意义(P>0.05)。
1.2 基因分型
用酚/氯仿抽提法提取DNA,然后采用TaqMan方法进行基因分型。引物、探针由应用生物系统公司(Applied Biosystems)设计提供。所有样品试验均在384孔板上完成,用ABI PRISM 7900HT仪器检测。
1.3 统计分析
用χ2检验检测基因型分布在健康对照中是否符合Hardy-Weinberg平衡;用非条件性Logistic回归分析估计相对发病风险,并以优势比(ORs)和95 %可信区间(95 % CIs)表示。所有的OR值都平衡了性别、年龄、吸烟和饮酒等因素的影响。
2 结果
在正常对照中,rs7943115的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。SNP rs7943115与胃癌的发病没有关联。
3 讨论
目前,胃癌在恶性肿瘤中发病率高、死亡人数多,我国每年因胃癌死亡16万人。目前,早检查、早治疗是降低胃癌死亡率的最关键手段,通过一些生物标记,如胃癌易感基因来判定胃癌发生的高危人群,从而采取有针对性的预防和治疗措施势在必行。
MUC6基因位于11号染色体短臂15区5带[5],这一区域在胃癌中经常显示杂合性丢失[6],因此,该基因是胃癌分子遗传学研究的一个重要候选基因。MUC6基因SNP rs7943115位于MUC6基因的3’区域,因此我们推测它可能通过影响RNA的稳定性以及二级结构,从而对MUC6基因的表达或功能起到一定的调控作用,但我们的研究结果显示这个MUC6基因SNP与胃癌没有关联。鉴于在我国这是首次研究MUC6基因多态性与胃癌的关系,因此需要其它研究来证实我们的结果。
【参考文献】
[1] Blaser MJ.Helicobacter pylori and gastric diseases[J].BMJ,1998,316(7143):1507-1510.
[2] Peek RM Jr,Blaser MJ.I Helicobacter pylori and gastrointestinal tract adenocarcinomas[J].Nat Rev Cancer,2002,2(1):28-37.
[3] De Bolós C,Garrido M,Real FX.MUC6 apomucin shows a distinct normal tissue distribution that correlates with Lewis antigen expression in the human stomach[J].Gastroenterology,1995,109(3):723-734.
[4] Reis CA,David L,Carvalho F,et al.Immunohistochemical study of the expression of MUC6 mucin and co-expression of other secreted mucins (MUC5AC and MUC2) in human gastric carcinomas [J].J Histochem Cytochem,2000,48(3):377-388.
[5] Pigny P,Guyonnet-Duperat V,Hill AS,et al.Human mucin genes assigned to 11p15.5:identification and organization of a cluster of genes[J].Genomics,1996,38(3):340-352.
[6] Moskaluk CA,Rumpel CA.Allelic deletion in 11p15 is a common occurrence in esophageal and gastric adenocarcinoma[J].Cancer,1998,83(2):232-239.