SYBRGreen实时荧光RTPCR检测痰脱落细胞中MAGE mRNA的表达
发表时间:2010-11-05 浏览次数:436次
作者:夏大文 唐艳 万敏 李亚荣 曲荣峰 石光 孙艳 刘晓霞 作者单位:吉林大学第二医院肿瘤内科,吉林 长春 130041
【摘要】目的 探讨肺癌患者痰液中黑色素瘤抗原基因MAGE mRNA的表达及其对肺癌早期诊断的意义。方法 建立以MAGE基因A1A6亚型通用引物进行 SYBRGreen实时荧光RTPCR的检测方法,并应用其检测14例肺癌病人和11例肺良性疾病病人痰液中MAGE基因 mRNA的表达。结果 14例肺癌病人中6例检测到痰液脱落细胞中有MAGE基因mRNA表达,检出率42.9%(6/14);在对照组肺良性病变者中未检测到MAGE基因mRNA的表达,两组差异有统计学意义(P<0.05)。另外,该法检出率大于痰液脱落细胞的细胞学检查检出率 21.4%(3/14),但无统计学差异(P>0.05)。结论 MAGE A1A6亚型基因的 mRNA可作为检测肺癌患者痰液的肿瘤标记物,SYBRGreen实时荧光RTPCR检测痰脱落细胞中MAGE mRNA可能有助于提高肺癌的检出率。
【关键词】 肺肿瘤;MAGE;RTPCR
笔者根据文献采用MAGE A1A6亚型通用引物通过巢式RTPCR法在痰液中检测MAGE mRNA的表达,取得较好进展,提高了肺癌细胞的检出率〔1〕。荧光实时PCR技术具有敏感性高、重复性好、速度快和污染少等优点〔2〕,目前尚未见以MAGE A1A6亚型通用引物通过SYBRGreen实时荧光RTPCR检测痰液脱落细胞中MAGE mRNA表达的报道。本文采用SYBRGreen荧光实时RTPCR技术,对14例肺癌患者痰标本脱落细胞中的MAGE mRNA进行了检测,同时探讨其对肺癌的辅助作用。
1 对象与方法
1.1 对象
我院收治的14例肺癌患者,均经病理科确诊,男8例,女6例,年龄26~76岁,平均年龄56.3岁。11例肺良性疾病病人(肺结核6例、支气管炎5例)作为阴性对照。病理类型为鳞癌4例,腺癌8例,小细胞未分化癌1例,细支气管肺泡癌1例。肿瘤TNM分期为Ⅰ期1例,Ⅱ期3例,Ⅲ期7例,Ⅳ期3例。痰液脱落细胞细胞学检查参见我院病理科脱落细胞室诊断报告。
1.2 方法
1.2.1 试剂
Trizol试剂为invitrogen公司产品;AMV 逆转录酶等逆转录试剂购自promega公司;DNA Tag酶及pMD18T 载体购自北京鼎国生物化学公司;20 ×SYBR GreenⅠ染料为OPE公司产品。引物由上海生工生物技术有限公司合成。
1.2.2 痰液采集及处理
采集每例入选者治疗前自然咯出痰及诱导痰液共5 ml。痰液采集方法如下:于超声雾化器雾化杯中加入4%的NaCl溶液10 ml,吸入高渗盐溶液15~25 min,嘱病人漱口,用力咯出深部痰。痰液处理方法:合格痰中加入4倍体积0.3%二硫苏糖醇(DTT)充分混合,将痰液置37℃水浴10 min,分置于5个试管,以1 000 r/min离心5~10 min,收集沉淀,每管加入Trizol 1 ml,用一次性注射器进行反复抽打形成清亮不黏稠的液体,-70℃冻存。
1.2.3 RNA提取
Trizol一步法进行细胞总RNA的抽提。用无RNA 酶的DNA酶Ⅰ处理,以提高RNA纯度。
1.2.4 RTPCR扩增及cDNA合成
逆转录反应在10 μl反应混合物中进行,包括 50 mmol/L Tris HCl,75 mmol/L KCl,1 mmol/L MgCl2,0.1 mmol/L dNTP,0.5 μmol/L特异性引物,5 U的AMV逆转录酶及提取的全部RNA,合成条件为45℃ 45 min。特异性引物序列参见文献〔3〕。上游:5′CTGAAGGAGAAGATCTGCC3′,下游:5′CTCCAGGTAGTTTTCCTGCAC3′。
1.2.5 参比模板质粒构建
以RTPCR一步法获得的PCR产物(巢式PCR扩增MAGE基因首轮PCR产物)纯化后,克隆至pMD-18 T载体,扩增、质粒提取及进行cDNA序列测定(北京赛百盛公司)〔1〕。
1.2.6 实时荧光PCR反应及标准曲线绘制
根据文献〔3〕设计上、下游引物,分别为上游:5′CTGAAGGAGAAGATCTGCCWGTG3′,下游:5′CCAGCATTTCTGCCTTTGTGA3′,扩增片段长度为469~493 bp。扩增体积20 μl,分别加入0.5 μmol/L的引物,0.2 mmol/L dNTP浓度,2.0 mmol/L MgCl2,0.6 U Tag DNA合成酶,20 ×SYBRGreenⅠ0.5 μl 及10 μl cDNA。扩增条件为:95℃ 5 min,95℃ 15 s,60℃30 s,72℃30 s,循环40次。提取参比模板质粒,紫外分光光度计检测质粒A260 nm吸光度值,根据质粒分子量计算质粒浓度,定量后将重组质粒标准品原液按梯度稀释成2.5×107、2.5×106、2.5×105、2.5×104、2.5×103、2.5×102,2.5×101拷贝/μl,分别取每一数量级稀释液2 μl作为PCR模板。同时设立以水和空载质粒为模板(即靶基因拷贝为0)的对照反应。将实时定量RTPCR产物从50℃缓慢而均匀地升温至10℃,温度每升高0.2℃读一次荧光值,每2次读值间隔1 s。反应结束,由实时荧光定量PCR仪(罗氏light Cycler 2.0)自动绘制熔链曲线。
1.3 统计学分析
率的比较采用χ2检验和Fisher′s Exact检验。
2 结 果
2.1 SYBRGreen荧光实时RTPCR检测方法建立
将报道的首轮PCR 产物与pMD18T 载体连接后,转化大肠杆菌得到重组质粒,PCR 法和酶切鉴定阳性克隆,可观察到约850 bp大小的特异性扩增条带(图1)。经测序后证实序列正确。把不同稀释度的参比模板同时进行定量PCR检测,用Ct 值与其对应的不同定量模板的对数拟合作图,得出一条定量标准曲线。在(101~107)拷贝/ml范围内,Ct 值与起始模板浓度具有良好的线性关系,相关系数>0.990,见图2。用该法对11例肺良性疾病病人痰检测,发现有2例检测结果在101数量级,其余9例未能检测到。因此,设定检测结果低于102个拷贝数量级为阴性标本。 反应结束后,仪器自动进行了熔解曲线分析,温度峰值与预期Tm值一致,特异性扩增产物熔解温度均一、峰形锐利。
2.2 SYBRGreen荧光实时RTPCR检测MAGE表达结果
14例肺癌患者中,6 例(42.9%)检测到MAGE mRNA的表达,在对照组11例良性病人均无阳性结果,两组差异有统计学意义(Fisher′s Exact检验,P<0.05)。其肺癌检出率大于痰液脱落细胞细胞学检查检出率 21.4%(3/14),但差异无统计学意义(P>0.05)。
3 讨论
SYBRGreen Ⅰ荧光定量PCR 是近年出现的高特异、高灵敏的定量PCR方法〔4〕。在PCR反应体系中,加入过量SYBRGreen Ⅰ荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,荧光信号增强,而不掺入链中的SYBRGreen Ⅰ染料分子荧光不变,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。荧光可以在退火阶段或者延伸阶段测定。当信号达到一定的阈值,此时的循环次数(Ct 值) 被记录下来,Ct 值和PCR 反应体系中起始DNA或cDNA 量的对数值有严格的线性关系,从而达到定量的目的。本研究利用既往研究中已获得的巢式PCR首轮PCR产物T载体克隆质粒做为参比模板,然后建立了该重组质粒的标准曲线,结果显示,在(101~107) 拷贝/ml范围内,Ct 值与参比模板浓度具有良好的线性关系(r>0.990)。
与TaqMan法相比,SYBRGreen Ⅰ法无需另外设计荧光探针,无需特别优化条件,简便易行,成本较低,能适用于任何一款定量PCR仪,与普通PCR 相比,SYBRGreen 实时荧光定量PCR 不需要PCR 后续的电泳步骤,减少了污染的可能性。然而正是由于荧光染料能和任何双链DNA结合,因此它也能与DNA引物二聚体或其他非特异扩增产物结合,使试验容易产生假阳性信号。但通过严格控制引物质量、纯化模板和设计对照,能很好地解决假阳性信号。本实验通过溶解曲线可以看到避免了引物二聚体的产生,具有很高的特异性。另外,良性疾病对照标本中均未检测到MAGE基因的表达,也说明所采用的方法具有特异性。
黑色素瘤抗原基因MAGE是一种特异性很高的肿瘤特异性抗原,仅特异高表达于癌组织,如肺癌、胃癌、食管癌等,但在正常组织(胎盘和睾丸组织除外)不表达或微量表达〔5〕。其每一种亚型在癌组织中的单独表达率均较低,但MAGE A1A6 6种亚型在恶性肿瘤组织的共同表达率却很高〔3〕。采用MAGE A1A6通用引物及巢式RTPCR检测肺癌患者痰液中MAGE基因的表达,文献报道可获得41.8%(随机痰)及72.7%(诱导痰)的检出率〔6〕。本组在既往研究中由于受到检测试剂及样本例数等的限制,仅获得30.4%(4/23)的检出率(随机痰或诱导痰)〔1〕。在本研究中,采用SYBRGreen荧光实时RTPCR技术,使MAGE基因在肺癌患者痰液中表达的检出率升高至(42.9%),本实验采用的痰液为诱导痰,大于笔者既往报道在混合痰中的MAGE基因检出率,但低于文献报道的检出率。关于采用两种技术方法所获得的检出率的比较有待进一步研究。良性疾病对照标本中未检测到MAGE基因的表达,说明本研究所采用的方法具有特异性。
本组结果表明MAGE A1A6亚型基因的 mRNA可作为检测肺癌患者痰液癌细胞的标记物,应用SYBRGreen实时荧光RTPCR对痰脱落细胞中MAGE mRNA表达的检测可能有助于提高肺癌检出率。
【参考文献】
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